El IGBJ es sede del La Paz WGO Training Center desde 2005 y se constituye en la institución ejecutora de los programas internacionales de capacitación.

El IGBJ es producto de la cooperación en salud que el pueblo y el gobierno del Japón prestan a Bolivia. Es una institución pública y universitaria con 29 años de actividad asistencial, investigativa y docente, en niveles de pre y postgrado.

El IGBJ está equipado con  alta tecnología para atención de enfermedades digestivas, con avanzado desarrollo de técnicas de diagnóstico y tratamiento, dotado de adecuada infraestructura para el desarrollo de programas de entrenamiento.

Tiene integrados los servicios de clínica médica, cirugía, patología, radiología diagnóstica e intervencionista, endoscopia diagnóstica y terapéutica, ecografía diagnóstica e intervencionista, ultrasonido endoscópico, motilidad y pHmetría.